La scelta di rivolgersi ad un trattamento con agopuntura non deve essere "ideologica", ma deve fondare le sue motivazioni sui principi dell'efficacia e della non tossicità che ha l'agopuntura.
L'agopuntura dà la possibilità di non utilizzare i farmaci o ridurne il dosaggio quando questi non possono essere completamente eliminati. Questo significa eliminare o ridurre gli effetti collaterali e la tossicità dei farmaci. Quindi qualora ve ne siano le indicazioni il trattamento con agopuntura dovrebbe rappresentare la prima scelta di terapia, in particolare in alcune circostanze quali ad es. la gravidanza, oppure in patologie quali la cefalea cronica dove l'abuso di analgesici è frequente ed è causa di cronicizzazione del dolore.